O blog da NVIDIA postou um registro sobre o sequenciamento de DNA mais rápido. O genoma do paciente foi completamente decifrado em 5 horas e 2 minutos. Antes disso, essas operações exigiam dias e até semanas. A ciência provou que chegou perto de conseguir decifrar informações genéticas quase em tempo real, o que ajudará a combater doenças e salvar vidas.
Fonte da imagem: Steve Fisch, cortesia da Universidade de Stanford
É relatado que o recorde foi estabelecido por pesquisadores da Universidade de Stanford com a participação da NVIDIA, Oxford Nanopore Technologies, Google, Baylor College of Medicine e da Universidade da Califórnia em Santa Cruz. O experimento em si foi realizado há mais de um mês ao sequenciar o DNA de 12 pacientes. Um artigo sobre o trabalho foi publicado recentemente no The New England Journal of Medicine. A confirmação oficial do recorde também ocorreu recentemente no Jensen Huang Engineering Center da Stanford University, em homenagem ao fundador e CEO da NVIDIA, um ex-aluno de Stanford.
Os pesquisadores alcançaram velocidades recordes otimizando cada etapa do fluxo de trabalho de sequenciamento. Eles usaram o sequenciamento de nanoporos de alto rendimento nas células de fluxo PromethION da Oxford Nanopore para gerar mais de 100 gigabases de dados por hora (uma gigabase é um bilhão de nucleotídeos) e pesquisas de base e variantes aceleradas usando GPUs NVIDIA no Google Cloud. Para cinco pacientes, o sequenciamento de DNA foi concluído dentro de um dia de trabalho típico (7-8 horas), e para um levou um tempo recorde de 5 horas e 2 minutos.
«Acho que somos unânimes que isso é nada menos que um milagre”, disse Kimberly Powell, vice-presidente de assistência médica da NVIDIA. “Esta é uma conquista que ficará nos livros de história e inspirará outros 5 a 10 anos de trabalho fantástico na revolução da biologia digital, na qual a genômica está na vanguarda.”