AI Google está pronta para resolver o maior desafio da biologia dos últimos 50 anos – imaginar a forma de todas as proteínas conhecidas pela ciência

As sequências de aminoácidos, quando combinadas umas com as outras, dobram-se em centenas de milhões de formas de proteínas bizarras, que eram impossíveis de prever – apenas para estudar em laboratório. O progresso foi delineado com o advento das tecnologias de IA na biologia, e agora um avanço está sendo preparado – a estrutura do DeepMind do Google promete apresentar em breve a forma de todas as proteínas conhecidas pela ciência, que irão multiplicar a busca por novas drogas e levar a outras descobertas em biologia.

Fonte da imagem: DeepMind

DeepMind ainda não foi capaz de deixar o Google, mas promete criar um banco de dados aberto de todas as formas de proteínas previstas. Isso acontecerá em alguns meses e promete ser o evento mais ambicioso da história da biologia. Os programas de previsão da forma da proteína estão sendo desenvolvidos por muitas empresas e equipes de pesquisa, mas o pacote AlphaFold DeepMind mostrou a maior precisão na previsão da forma. Essas ferramentas são de domínio público, e um banco de dados de proteínas pronto para uso facilitará muito o trabalho de biólogos em todo o mundo – pegue-o e use-o.

AlphaFold pode prever a forma de proteínas com precisão atômica. Mas uma precisão ainda menor permite que novos medicamentos sejam desenvolvidos, fornecendo informações sobre a configuração espacial aproximada de proteínas até então não estudadas. Portanto, se nos últimos 10 anos os biólogos foram capazes de estudar a estrutura de apenas 17% das proteínas humanas, o AlphaFold em questão de semanas dobrou a base das formas de proteína humana para 36%. Esta informação ainda não foi verificada, mas o algoritmo AlphaFold já provou seu valor no passado.

Além das proteínas humanas, a DeepMind promete apresentar as formas proteicas de 20 dos organismos mais estudados, desde leveduras a moscas da fruta, camundongos e outros – até centenas de milhões de formas proteicas. Hoje, o banco de dados DeepMind contém informações sobre 350 mil formas de proteínas previstas, mas em poucos meses será expandido para mais de 100 milhões de formas, onde estarão quase todas as proteínas mais ou menos conhecidas pela ciência. As proteínas que assumem forma espacial quando combinadas com outras proteínas ainda não foram estudadas, mas esta será a próxima noz para a IA.